Proteíny

Aj keď je mäkká kontaktná šošovka dobre ošetrovaná, je náchylná na prienik proteínov, ktoré môžu denaturovať a pôsobiť na oko antigénne. Spolu so zvýšeným množstvom proteínov rastie aj počet baktérií, a tak môže dôjsť k infekcii.

Preto sa odporúča zvoliť taký materiál kontaktnej šošovky, aby ukladal čo najmenej depozít. Zároveň je vhodné, aby proteínové depozitá boli fyziologicky kompatibilné s okom. Kontaktné šošovky by sa mali vymieňať čo najčastejšie, ideálne sú jednodenné kontaktné šošovky. Inou možnosťou je výmena mäkkých kontaktných šošoviek za tvrdé.